文件第三条规定，科技厅和省地方金融监管局为创新基地的管理部门，其主要职责包括：会同四川省科技金融工作联席会议成员单位开展创新基地评审工作；对创新基地进行管理、监督和绩效评估；研究制定支持创新基地建设和运行的政策措施。

文件第四条说明，四川省科技金融工作联席会议成员单位及其他有关省级部门、各市（州）科技行政主管部门作为创新基地的推荐部门，其主要职责为：按照各自职能组织管辖范围内企事业单位的申报、推荐工作；各市（州）科技行政主管部门配合本地区金融工作局组织单位申报、推荐；积极支持创新基地建设与发展，提供业务指导等。